Я не понимаю, зачем все эти лимиты?

Благодаря данным лимитам сайты наших клиентов а также наши серверы надёжно защищены от атак и других неприятных для каждого клиента последствий.
Именно поэтому наши серверы сохраняют очень высокий аптайм на протяжении длительного времени.

Как обойти лимиты хостинга.

Обойти лимиты невозможно, а попытки обхода могут привести к блокированию пользовательского аккаунта.
Мы могли бы не ставить такие лимиты, в этом случае сервер бы "падал" от малейших намёков на атаки или повышенные нагрузки некоторых пользовательских скриптов.