Сразу после активации Cpanel хостинга вы увидите несколько папок и файлов созданных изночально. Это системные данные и их не рекомендуется удалять!
/public_html - Ваш web-каталог, размещайте здесь файлы и папки Вашего сайта;
/www - псевдоним (alias) папки public_html;
/public_html/cgi-bin - каталог для размещения ваших собственных CGI-скриптов;
/public_ftp - каталог для анонимных ftp-посетителей;
/_private - служебная часть для MS FrontPage Extensions;
/_vti_* - служебная часть для MS FrontPage Extensions;
/etc - служебная часть системных настроек Вашего домена;
/mail - служебная часть почтового сервера;
/tmp - служебная часть статистики посетителей Вашего домена;
/.trash - папка корзины;
/logs - службная папка в которой находятся логи вебсервера и FTP подключений.